印尼是最多穆斯林人口的國家，雖然「清真」食品有嚴格的規定，不過，由於相關單位在食品安全把關上未臻完善，也曾傳出幾波食安問題，從燕窩到咖啡豆，一度讓消費者怕怕。
印尼盛產燕窩，被稱為「燕窩之鄉」。印尼燕窩占全球燕窩總產量的80%、馬來西亞占13%、泰國占5%、越南占2%。在印尼一些偏鄉小城鎮裡，幾乎家家都蓋燕子屋。印尼燕窩也是包括台灣老饕在內許多亞洲消費者的首選。
不過，就在前年底，「毒血燕」的報導讓消費者聞之色變。台灣從印尼進口的兩批燕窩乾貨被檢出含有亞硝酸鹽，含量分別高達1820ppm、66.9ppm，違反國內規定。
「毒血燕」的消息最早來自中國大陸的報導，報導血燕窩驗出亞硝酸鹽，中華民國衛生署（現為衛生福利部）於是開始在邊境採逐批查驗方式，發現兩批來自印尼的產品確認不合格。
已逝的前林口長庚醫院臨床毒物科主任林杰樑曾表示，亞硝酸鹽是一種人工防腐劑，在人體內會轉換為致癌物亞硝胺，長期食用將升高腸胃罹癌風險，還會影響肝功能，甚至增加罹患糖尿病、心血管疾病機會。
他說，亞硝酸鹽也具有增色功能，天然環境中也會殘留微量的亞硝酸鹽，部分印尼燕窩被驗出亞硝酸鹽最高檢出量1820ppm，吃多可能有慢性中毒疑慮。
此外，向來備受觀光客喜愛的印尼咖啡也一度傳出有問題。首先是有「世上最昂貴咖啡」之稱的麝香貓咖啡，這種咖啡豆可產製每杯價格高達80美元（約新台幣2364元）的咖啡。
不過，印尼麝香貓咖啡「假貨充斥」的消息時有所聞。印尼媒體日前報導，印尼有一種類似麝香貓的貓科動物，印尼話叫做「Musang」，由於售價比麝香貓便宜，食量比麝香貓大，常常被咖啡業者購買來餵養，之後以產出的咖啡豆混充麝香貓排洩出來的咖啡豆，對外販售。
由於麝香貓咖啡在全球熱銷，導致印尼當地野生麝香貓咖啡豆產量嚴重不足，於是當地人開始人工飼養麝香貓，用香蕉和咖啡餵養，催產並收集糞便成了印尼一項產業，導致印尼有不少人工飼養的麝香貓咖啡進入市場。
此外，印尼琳瑯滿目的各種咖啡品牌，日前竟也被檢驗出含有禁藥成分。
印尼衛生單位去年市面上有超過22種咖啡豆，被檢測出含有西地那非（sildenafil）（其中一種劑型為熟知的威而鋼）和他達那非（tadalafil），恐會引發頭疼、噁心、肚痛、視力模糊、心悸、永久喪失性能力或死亡。
不過，對於愛喝咖啡、路邊小販處隨手可購得咖啡的印尼民眾而言，這項消息似乎並未降低他們對咖啡的熱愛。（詳細報導內容請見「全球中央」雜誌2013年12月號）