高雄市環保局勒令日月光K7廠停工，環保署今(21)日上午發布新聞稿，稱讚高雄市府執行汙染稽查發現偷排及暗管的其他嚴重違規案例，立即斷然下令停工，無所畏懼，晚間卻又發布新聞稿批評，高雄市政府的八大日月光停工理由，多是平時事發前就可要求改善的項目，暗諷高雄市未盡稽查責任。
環保署上午指出，高雄市政府主動稽查發現日月光高科技廠違規，命令停工而高雄地檢署收押相關嫌疑人員的事件，經過媒體關注大幅報導，在環境汙染管制工作上，已發揮極為正面的效果。
另外，環保署也認可高市府一改過去三次才停工的作法，斷然下令停工。環保署說，對於市政府裁罰過程集合市府相關局處深入論證，站穩腳步毋枉毋縱的作法，環保署予以高度肯定。
不過，環保署晚間表示，透過高雄市政府99年4月22日二封分別給日月光及經濟部南梓加工出口區管理處，同意日月光4月17日已完成緊急海洋放流的公文，可得知高雄市政府應是同意日月光的緊急排放連接管，經由加工出口區的海洋放流管排放至海中，但在12月中市府又說是暗管及偷排。
環保署批評，高雄市政府的八大日月光停工理由，除了故障不報備且未停產或降產而繼續排放外，其他理由均顯薄弱。「因為這些理由是平日稽查或發生前就可處罰或要求改善的違規，不必讓他累積成為重大污染再來勒令停工的理由，造成環保、經濟及勞工三輸的局面」。
環保署說，希望高雄市政府在後續訴願或訴訟中守住底線，讓日月光案只要有一項符合停工要件的事証成立，就可命令停工，否則手軟等到第三次，「會累死稽查人員」。