在花東民眾期盼下，馬英九總統要求原訂2015年通車的「花東鐵路電氣化工程」提早2年完工，也就是2013年完成，但目前預計要到2014年6月才能通車。
交通部鐵工局表示，目前因天災及承包商動員力造成工程進度落後等問題，已積極改善，請民眾見諒。交通部次長范植谷說：『(原音)陸陸續續大概有些颱風，雖然颱風沒有直接侵襲花東，但遇到颱風會迫使要停工，這一來一往就耽誤十幾天，另一個就是地質因素也造成工程不順利。』
交通部鐵工局長周永暉也表示，依照之前行政院核定的進度，是2015年完成台東鐵路電氣化，2020年完成全台鐵路電氣化。他說：『(原音)花東鐵路電氣化，其實在交通部整個施政主軸裡面，2015電氣化到台東，2020是整個環島鐵路電氣化完成，那麼我們如果能早一天完成電氣化，對國家的發展是一個具有指標性的目的。』
交通部也表示，鐵路電氣化工程每提早1年通車，將可節能16.67%，減少排碳量相當於28座台北大安森林公園的排碳量；另可提高2倍班車容量及減少30分鐘的行車時間。