整個展覽分4個單元、2個檔期展出，其中清廷文獻圖書資料就揭露清廷對台灣的族群政策、原漢之間的互動關係。例如清高宗為了解原住民狀況，曾諭令各地封疆大吏將所轄境內少數民族與外國人士繪圖進呈，按各繫圖說彙編成「職貢圖」與「皇清職貢圖」。在這項全面性的民族調查計畫中，台灣原住民也被畫成13幅圖像，略述其衣著樣貌與性情習俗。乾隆中葉所彩繪的「臺灣地圖」，則藉由山水畫形式，描繪330個原住民部落的名稱與相對位置。
此外，康熙也曾對台灣充滿好奇，除讓地方官員將台灣各式土產貢獻進呈，更精選身負才藝的原住民入京。乾隆年間，原住民甚至被安排參與皇帝80歲的萬壽慶典，獲封厚賞賜。
在原住民與外在世界接觸的過程中，西方人士也留下不少紀錄。蘇格蘭攝影師約翰‧湯姆生(John Thomas)在來台旅途中拍下數十幅珍貴照片，這些照片後來被轉繪為各式畫報，流傳甚廣，成為西方了解台灣原住民的重要參考文獻。
配合「台灣原住民文獻圖書特展」，故宮同時製作「赴京朝覲-台灣原住民進京傳奇」沙畫影片，並邀請泰雅族的林慶台牧師配音，帶給觀眾視覺、聽覺的多重體驗。