攸關廢除特偵組的「法院組織法部分條文修正草案」，民進黨立院黨團在13日院會上發動突襲，要求變更議程將該案改列為討論事項第一案，因此院會隨即進行「不記名表決」。經過兩輪投票，因為有國民黨立委跑票，所以兩輪分別都是以贊成票居多，在野黨團提出的「法院組織法部分條文修正草案」就順利列為討論事項第一案。
民進黨立院黨團書記長吳秉叡利用廣泛討論程序時建議，本案應在院會停止討論，直接交由表決處理。針對這項提議，國民黨團提出異議並要求表決，在人數優勢下否決吳秉叡的提議。但本案還是以逐條討論程序進行，國民黨立委吳育昇發言時，就譴責重大制度的變更，不應該以「不記名」方式處理。吳育昇說：『(原音)如果這是一個這麼重大的制度，對國家影響這麼重大，怎麼可以用不記名投票呢？我們認為這是最不負責任的方式，國家不能這樣搞。』
隨後，國民黨團為了避免再有跑票情況，提出散會動議，並要求記名決表來加以防堵；經過兩輪投票，最後通過散會動議。針對在野黨團變更議程成功，立法院長王金平會後受訪表示，可能國民黨團還沒進入狀況。王金平說：『(原音)沒有任何黨團提出要記名表決的單子，沒有人要求，所以就是不記名。可能他們還沒有進入狀況吧，可能沒有即時去了解，他們連廣泛討論都沒有去登記，人家都登記6、7位了。』
王金平也說，院會已經對「法院組織法部分條文修正草案」做出另定期處理的決議；由於院會通過國民黨團提出的散會動議，因此表訂下周二的院會，也不會召開。