檢方指出，南仁湖集團為搶標台北車站大樓整建營運及商場租標案，負責人李清波涉嫌於民國95年間，指示他人將2萬美元裝入茶葉罐，交給郭瑤琪。郭瑤琪事後在交通部部務會報對標案關切。
台北地檢署於96年3月間偵查終結，將郭瑤琪依貪污治罪條例起訴，具體求刑有期徒刑8年；李清波等人則獲不起訴處分。
法院一、二審時都認為，郭瑤琪縱收2萬美元，但未對招標案有具體指示或影響招標程序的行為，且南仁湖集團最後也未參與投標，認定郭瑤琪收款與職務並無構成對價，判她無罪。
檢方上訴後，高院更一審認為收款與職務構成對價，改判有罪。高院更二審判決郭瑤琪8年徒刑、褫奪公權4年。最高法院今天駁回上訴，全案定讞。