縣府秘書長陳朝旺表示，清境地區因一直沒有都市計畫，長期來衍生民宿亂象，內政部預定於明年頒行「清境風景特定區都市計畫」，未來在都市計畫架構下，預估可輔導約70%的業者合法化，並非所有業者都能合法。
「看見台灣」影片引發政府及各界正視並探討國土保育議題，南投地檢署正積極偵辦清境農場地區的違法民宿，南投縣政府也就建築法取締違規民宿。
檢方表示，民國100年起就清境地區民宿進行清查、偵辦工作，經內政部國土測繪中心、南投縣政府地政處等單位協助，展開167家民宿、農場的測繪工作，目前先針對已函復測繪成果圖的139家業者，就竊占罪、違反水土保持法、山坡地保育利用條例等部分偵辦，已簽分偵案80家。
檢方指出，這80家民宿中，有39家不起訴，18家涉及侵占國土但自行回復原狀或取得合法承租地，給予緩起訴；14家業者被提起公訴，多是民宿周邊設施，例如停車場、景觀造景等部分涉及侵占國土，主建築部分並未侵占國土。
南投地檢署主任檢察官林柏宏說，地檢署偵辦清境地區民宿，主要是針對刑事不法行為，主管機關縣府則就違反建築法部分取締開罰，如有明顯立即危險的違建仍應拆除。
陳朝旺表示，目前清境地區的土地多為農牧區用地，不少蓋在農牧用地的民宿以農舍名義興建，因建蔽率只有10%，因此不少民宿被認定為違建。
他說，縣府新訂的「清境風景特定區都市計畫」已送內政部審議，明確規劃旅館區、商業區、住宿區等分區使用，地方希望中央能早日通過，以根本解決現有問題，讓業者能有就地合法的機會，不過，有危險性或涉及竊占國士、影響水土保持的民宿仍無法合法化。