大陸劃定防空識別區，引發各方高度關注，除立法院外交及國防委員會邀請相關單位就「中國公布東海防空識別區之影響及因應作為」提出報告並備詢外，國家安全會議也於每週一下午例行性會議提出相關討論。
相關人士說，馬總統在例行性會議中指示相關部會就涉及議題，對外說明，以釐清外界疑慮。
此外，對於立法院外交及國防委員會邀請國家安全會議秘書長袁健生列席並備詢，但袁健生缺席一事，國安會發布聲明稿提出說明。
國安會指出，依據憲法增修條文第二條第四項及國安會組織法第二條第一項規定，國安會是總統決定國家安全大政方針的諮詢機關，依憲政體制及慣例，除有關國安會的法律案或預算案外，不宜至立法院報告備詢或發表意見，以符體制。
國安會表示，外交部長、國防部長、陸委會主委、國安局長等政府首長均為國家安全會議主要成員，參與相關會議，有充分的專業判斷與代表性，足可在主管範圍內，依據憲政體制，在立法院報告政策並答覆詢問。