商業周刊上週報導市售鮮乳、調味乳，以定性方法檢驗代謝物，顯示有禁藥殘留。農委會因此抽驗了商周所稱的8款牛乳之外，還加碼抽驗了市售15個品項的鮮乳。檢驗結果25日出爐，包括止痛劑、86種抗生素，以及衛福部負責檢測的荷爾蒙、抗憂鬱劑等，均未檢出；塑化劑則是部分檢出，但在國家標準值以下。農委會表示，希望檢驗結果能讓消費者，安心食用國產鮮乳。
其中，荷爾蒙及抗憂鬱劑是由衛福部負責檢驗，抗生素、止痛劑、塑化劑則是兩個單位都檢驗，而農委會檢驗抗生素86種，包括磺胺劑及奎諾酮類48項、四環黴素類7項、氯徾素類3項，以及β-內醯胺類8項、硝基呋喃代謝物4項，以及紅黴素16項。塑化劑的部分，農委會檢測7項，衛福部檢測9項。
農委會指出，在國家認證實驗室內，依照國家公告的檢測方法，或是參考國際規範的檢測方法，在很短的時間內將乳品的藥物殘留檢測做完，就是希望儘快澄清消費者疑慮，實在不忍心看這種報導造成的恐慌，讓媽媽們急到哭。
至於對酪農的生乳產銷是否已經造成影響？農委會並不願意透露受影響的程度，僅表示目前鮮乳消費市場其實還是陷於恐慌，在檢測結果全面出爐後，希望能夠在短期內迅速獲得澄清，讓影響期減到最短。
毒物專家林杰樑遺孀譚敦慈，日前向媒體表示沒有看過商周的報告，但是他們家一向不喝牛奶，其中一個原因就是，台灣的合法動物用藥有1百多種，歐盟才30多種，所以他們不喝。
對此，農委會澄清這是個誤會，乳牛的合法動物用藥只有48種，但藥物殘留檢測有上108種，檢測項目多是因為擔心酪農會使用非法藥物，所以把酪農有可能用到的藥品，都列入檢驗項目。
至於乳牛的48種法動物用藥，還是比歐盟的30多種來得多，原因為何？農委會解釋，乳牛在溫帶及熱帶，所可能罹患的疾病是不同的，因為不僅使用藥物種類不同，劑量也會不一樣。
商業周刊也發表聲明指出，基於媒體扮演吹哨者立場，報導乳品中存在藥物殘留的疑慮，雖然雙方檢驗方法不同，結果各異，但仍希望各界一起找出更具前瞻性、全面性的檢測方式與檢驗標準。