朱小丹在廣東經濟發展國際諮詢會記者會上表示，中國共產黨第18屆中央委員會第3次全體會議提出，大陸要實行自由貿易區的戰略，要形成面向全球的高標準自由貿易區網路。此外，三中全會決定明確提出「擴大對香港特別行政區、澳門特別行政區和台灣地區開放合作」。
因此，朱小丹說，粵港澳自貿區建設的出發點主要是兩個方面，第1是深化改革、創新體制，轉變政府的職能，實行世界貿易規則，構建法治化國際化營商環境；第2是擴大對外開放，深化粵港澳合作，率先構建廣東開放型經濟的新體制。
朱小丹也點明粵港澳自貿區未來將承擔的改革任務，包括簡政放權、改革行政審批、市場准入、商事登記、海關監管、檢驗檢疫等管理制度，能夠實行准入前國民待遇加負面清單的管理方式，實行統一的市場監管，加快建立法治化國際化營商環境。
據朱小丹說法，粵港澳自貿區有利於與「內地與香港關於建立更緊密經貿關係的安排（CEPA）」實施的先試先行，推動粵港澳生產性服務業、國際貿易、金融服務等合作。
上海自貿區掛牌後，隨著中共18屆三中全會決定自貿區戰略方向，包括粵港澳、天津等地都有意申請成為自貿區。