彭惠圓於民國100年上任後風波不斷，先是具有雙重國籍遭檢舉，經新北市前人事處長莊進國解釋，已於就職前簽下具結書，合乎公務人員任用法，風波暫告段落。
內部人員指稱，彭惠圓從寶島客家電台長轉任後，卻仍具有該台第8屆董事身分，直到去年第9屆選舉結束後才卸任，兼任期間長達2年，疑似違反《公務人員服務法》。
再者，客家局每年補助民間廣播電台製播客語節目，自從彭上任後，寶島客家電台年年獲得100萬元補助，其他如復興、大樹下等廣播電台，補助額度只有10萬到20萬元，最後因預算不足而停播。
去年底新北市率先成立客家網路電台，號稱24小時無時差播放客家節目，該案也是由寶島客家電台主導，明顯獨厚單一電台。
彭惠圓解釋，寶島客家電台屬公益性質，兼任並不違法，目前也已辭董事職務；新北市人事處長陳昭欽強調，兼任財團法人董事必須先行報備並經首長同意，才合乎程序。
至於獨厚單一電台？彭惠圓強調，她還沒上任前，客家局即已補助電台製播節目；她上任後，根據企畫書評選寶島客家電台內容最優良，一切可受公評，並無不法。
新北市議員陳文治批評，彭既然從寶島客家電台轉任，就應做到利益迴避，竟然還擔任董事、補助製播節目，明顯公私不分，市府應將她送監察院調查。