日前有民眾向議員反映，向縣府辦理興辦水權時，縣府規費3,700元、代辦費5,000元、縣府另收10,000元，共對農民收18,700元，民眾表示農民合法申請鑿井費用過高，讓農民很不能接受，雲林縣政府水利處特此聲明表示該項消息係為誤傳。
縣水利處表示，一般民眾向縣府辦理興辦水權時所需之規費是依照「水權登記收費標準」等相關規定向民眾收取費用，依每一申請案件分別收取登記費新台幣1,200元，水權狀費或臨時用水執照費新台幣500元，履勘費按主管機關，分別依下列各款收取:中央主管機關為新台幣1,500元。臺北市政府、基隆市政府、新竹市政府、嘉義市政府及離島地區(澎湖縣政府、金門縣政府、連江縣政府)為新台幣500元。前款以外之各直轄市、縣(市)政府為新台幣1,000元。
故以縣府為例，一般民眾向縣府辦理興辦水權時，縣府每一申請案件收取登記費新台幣1,200元，水權狀費或臨時用水執照費新台幣500元，履勘費新臺幣1,000元，合計為新台幣2,700元，所謂農民合法申請鑿井的費用需18,700元之消息係為誤傳。