環保署舉辦「中華民國企業環保獎」選拔活動，表揚國內積極推動環保的優良企業，至今辦理第22屆，超過257個單位獲獎，主要評比項目為環境保護規劃及管理、環境保護工作推行、環保觀念推行與教育等，分為六大類組評選，華航榮獲一般服務業組之「企業環保獎」獎項。
華航長期致力環保，依循各項國際管理規範，2007年開始進行航機節油作業，成為亞洲航空公司標竿；2009年主動配合環保署推動「ISO14064-1溫室氣體盤查與查證」作業，並列入常規管理；2011年率先國內航空同業推動ISO14001環境管理系統，提高環保績效及經營效率。
2013年7月更響應經濟部能源局企業自願專案，啟動ISO50001能源管理系統建制工程，10月將既有之「環境政策」擴增為「環境暨能源政策」，同時預定今年底完成ISO50001驗證作業。
環境保護工作推動方面，如華航園區設計採用綠建築概念、修護廠區使用節能燈具、設置室內廢棄物專用貯存場所、報廢工作車改裝為電動車、積極提供旅客ECO服務等。
華航同時也致力推行環保觀念，包含建架環保網頁、發布企業環境永續報告書、參與環保署、中央大學與歐盟合作之「太平洋溫室效應氣體觀測」計畫(PGGM計畫)及環保彩繪機、播放ECO服務微電影，以及機上雜誌採用環保紙張並發表環保文宣等作為；在內部教育宣導方面，包含舉行全員環保活動及e-learning、環保文宣、定期發送環保常識及員工提案系統等。1021109