但談到自經區開放新台幣業務，央行仍堅持不讓步，金管會則希望與央行再研議，雙方表面融洽，骨子底，誰都不讓。
彭淮南與曾銘宗昨赴立法院財委會報告自經區業務規劃。由於央行堅守「自經區規劃方案」中的金融商品開放不得涉及新台幣，與金管會的開放願景相衝突，引發外界關注。
彭淮南昨仍堅定表示，金融業的開放要審慎、注意風險，不涉及新台幣的境外金融業務開放早就做了，與自由經濟示範區是兩碼子事，不必然要掛勾。
彭淮南強調，國際金融業務分行（OBU）和國際證券業務分公司（OSU）等境外金融業務的擴大開放，本來就不涉及新台幣，也不必然與自經區相關；至於涉及新台幣金融商品開放的部分，我國外匯資金進出、投資股市已經很自由，沒有問題。
相對的，金管會希望能藉由金融業納入自經區後的金融法規鬆綁，促進金融業務發展。在央行堅持下，金管會第一階段的開放方案，主要針對境外金融，不涉及新台幣。第二階仍希望研議開放「與台灣利率、匯率、台幣計價商品連結」的金融商品，此部分與央行堅持的「反對新台幣計價商品納入自經區」明顯衝突。
面對央行以美國雷曼兄弟破產經驗「示警」，曾銘宗尷尬地說，金融業務本來就是全境開放，第一階段在原有法規架構下就可推動，不必等自經區立法，也不涉及新台幣，納入自經區是利用推動自由化的趨勢「借殼上市」。第二階段涉及新台幣，會審慎與央行研議，「大家有共識才會推動」。
經建會主委管中閔則表示，將金融業納入自經區，只是希望和金管會合作一起推動更多鬆綁，「增加亮點」。換言之，自經區能做的業務，現在金融業已經在做了，即使有亮點，也沒賣點。