檢方查出，頂新也向之前遭撤銷GMP認証的大統生基公司買油，但經濟部日前對食品GMP129項食用油脂認證產品全面清查，依據食品衛生管理法的食用油脂類衛生標準進行檢驗，包括銅、汞、鉛及砷等項目，並加驗棉籽酚，卻沒有把「銅葉綠素」列入檢驗項目，也因此最後公布檢驗報告結果是全數合格。
經濟部日前處理大統生基問題油品時，雖然大統領有GMP認證的油品並沒有被查出添加葉綠素、棉酚等物質，但經濟部當時對外表示，大統事件是「誠信問題」，因而緊急撤銷17張大統油品GMP認證。原本經濟部今天(4日)緊盯問題油品的撤銷GMP認證進度，不過，經濟部工業局長沈榮津晚間表示，至今仍未收到地方衛生單位的公文，要處理撤照一事最快也要等到5日。目前衛福部將頂新和福懋公司多項油品列為違規食用油，其中，只有頂新旗下的「味全不飽和精華調和油」領有GMP認證，但這已涉及之前經濟部所提的誠信問題及外界觀感，頂新和福懋所有的油品GMP認證恐都將遭撤。