黑心油爆後，引發全民吃的恐慌，醫師潘建志擔憂，根據財政部數據，台灣去年進口了五千五百多公噸的棉籽油渣餅，也就是棉籽粕，政府不僅無法交代流向，過去也沒有抽檢棉籽粕中的棉籽酚；由於棉籽粕都是用來當作動物飼料，如果棉籽酚暗藏其中，恐怕會流入食物鏈中！
對此，農委會清查近三年進口棉籽粕，表示初步結果未外流；農委會26日指出，針對近3年進口棉籽粕進行追蹤流向，初步結果3家飼料廠進口棉籽粕均由澳洲進口，且均添加於家禽飼料取代部分黃豆粉，另2家進口作為栽培菇類太空包介質之廠商，也未流做其他用途，請消費大眾安心。
農委會表示，25日晚間確切掌握近3年進口棉籽粕廠商及進口數量後，即緊急通知3家進口棉籽粕飼料廠報送進口棉籽粕之使用流向，26日查察結果，3家飼料廠自101年5月份起迄本年3月份最後1批進口止共進口7,734公噸棉籽粕，均由澳洲進口，且陸續以2-3 %比例添加於家禽飼料中取代部分黃豆粉，並於本年5月間全部使用完畢。
農委會說，棉籽粕為美國、澳洲、中國大陸及印度等棉籽生產國經常使用飼料原料，但我國飼料廠使用情形並不普遍，故棉籽粕通常與玉米酒糟（DDGS）、花生粕、菜籽粕等產品同為取代黃豆粉原料；農委會規定飼料用棉籽粕中游離棉籽油酚最高含量為0.04%，飼料廠購買時均要求賣方提供檢驗報告。
農委會並表示，因棉籽粕進口數量相較於黃豆粉（每年需求量約200萬公噸）等大宗原料明顯少量，故並未就其品質進行抽驗，且因其纖維含量高，飼料添加量很少，動物適量食用棉籽粕後其中棉籽油酚可在體內被反芻胃微生物分解，或與游離胺基酸等物質結合而不被消化道吸收，隨著糞便排出體外，因此，不會影響動物健康或殘留於畜禽產品中而對消費者造成危害。
農委會也說，為瞭解另2家進口商進口棉籽粕使用情形，於26日會同台中市政府人員赴進口棉籽粕作為菇類培植太空包介質使用廠商倉庫瞭解，該2公司負責人為同一人，據負責人表示，該公司近2年自印度、巴基斯坦及中國大陸進口棉籽殼（與棉籽粕同一稅則號列），101年迄今進口約1,374公噸，用以作為栽培菇類太空包添加介質，該公司進口之產品是棉籽去除棉絮經過剝殼機分離後棉籽殼，由於棉籽殼不含油脂，填加棉籽殼太空包可增加栽培介質保水性，日本及韓國均普遍使用。
依據嘉南藥理科技大學專家表示，部分錦葵科植物含有棉酚(如棉花)，具有抵抗病蟲害效果，不溶於水及脂肪，因分子量大結構複雜，植物根毛無法吸收，在土壤或介質中會被微生物逐步分解，因此，無植物吸收棉酚疑慮。
農委會最後表示，棉籽粕不論添加於飼料中或作為栽培菇類太空包介質均不會殘留或轉移至畜禽產品或農作物，而進入食物鏈，請消費者安心。另外，其他公司進口棉籽粕（殼）均符合原申請輸入用途，且由各該公司提供流向資料顯示，並未流供其他產業使用，但為求慎重，除就書面資料查察外，農委會也將派員至各該公司做進一步查證。