農委會水產試驗所在台東知本溪出海口興建「東部海洋生物研究中心水產生物種原庫」園區，在海底鋪設宛如巨龍般水管，抽取深達628公尺海水，進行重要水產生物保種和育種，研發優質水產種苗。
9月21日，天兔颱風在海面掀起滔天巨浪，掏空海邊，破壞海底水管，導致種原庫的深層海水斷流，但至今將近1個月，因海水混濁，仍然無法找出水管確切被破壞的情形。
水試所東部中心研究員何源興表示，天兔颱風對山區造成很大的破壞，卑南溪和利嘉溪至今溪水混濁，剛好種源庫又位於海灣處，因此混濁的溪水流入海底往南流，剛好積在海灣處。
何源興表示，颱風過後，潛水夫4次下水探勘，都因為海底混濁無功而返，目前只能潛至海底53公尺處就無法再挺進了，研判可能在60公尺以下出問題。
何源興表示，目前以表層水因應，水產生物不受影響。