近期發生狂犬病疫情，農委會表示，未來管理工作重點將包含落實施打狂犬病疫苗及寵物登記、積極推廣絕育及多元推廣認養收容動物。未來將與地方政府合作，推動犬隻「三合一源頭管理減量方案」。將集中資源，針對偏鄉、山區等狂犬病防疫重點區域之犬隻，進行狂犬病疫苗施打、植入晶片辦理寵物登記及絕育手術。
發生鼬獾為主的狂犬病疫情後，偏鄉、山區為疫情管控重點區域。農委會表示，將規劃自2014年起，以偏鄉、山區為計畫執行區域，由地方政府通知當地民眾並排定期程，組織獸醫師與志工團隊下鄉進行三合一方案，為毛小孩們，特別是犬隻，同步施打疫苗、植入晶片完成寵物登記及絕育手術，根本減少寵物被拋棄或持續繁殖所衍生之防疫因難、車禍、追咬人或家畜禽等問題，並透過寵物登記建立飼主責任，使毛小孩均能被妥善照顧、不棄養，同時提升動物福利與民眾生活安全品質。
農委會對於目前在立法院審議的「動物保護法」部分條文修正草案，則希望透過立法規範，飼主原則應為所養犬隻節育，不可放任繁殖，付出國家寶貴財稅資源處理不負責任民眾所造成之流浪犬問題。另為提升寵物福利，該會亦於修正草案中納入寵物食品安全管理及使用人用藥物治療犬貓等規範，以保障寵物食的安全及醫療權益。
10月4日是「世界動物日」，為協助全國公立動物收容所能更有效送養收容動物，農委會已規劃推動更多元、具創意及高效度的送養專案，建立有組織、專業性的送養團隊，尋求對民眾更高能見度、參與度的送養介面，並導入整合行銷概念，例如「送嫁妝」、「回娘家」等，結合免費施打狂犬病疫苗或絕育補助等優惠，包裝送養收容動物的誘因，並達追蹤防疫的效果。同時尋找出更多的潛在動物送養管道，以積極結合動物保護團體、獸醫師團體及寵物服務產業等共同參與，希望民眾願以實際行動支持「認養代替購買」。