日前高公局兩度進行民調，20公里免費里程確定勝出，收費方案將以免費里程20公里，200公里內每公里1.3元、200公里後每公里1元為基礎，進行新版費率調整。
若以原方案試算，可發現目前走國道1號由台北到高雄經過9個收費站，通行費360元，計程收費後卻增加21元；走國道3號從中和到燕巢系統目前通行費360元，計程後為381元，引發長程貨運業者反彈。
交通部長葉匡時日前公開表示，長程通行費不宜較現階段高，要求高公局重新研擬配套。高公局幾經試算，將計程方案微調，微調範圍可能傾向調降長程費率，並首度納入夜間費率，針對夜間費率試算3、5、6、8折，確保長途費率能夠比計次階段還低。
試算發現，夜間費率需打到6折，長程費率才會比現階段低。若夜間費率為6折，國3關西到白河路段的日夜間通行費差額將破百元，國1台北到高雄日夜間通行費則相差152元。
高公局指出，計程收費仍有機會在年底前上路，明年春節可能是國道由計次改為計程收費後的第一個連續假期，過去連假實施的夜間暫停收費即將走入歷史，夜間將改為離峰費率。
計程收費計算複雜，在費率出爐後，民眾可由高公局官網、APP等試算通行費，高公局也將印製通行費計算小冊，供民眾試算。