據了解，台北地檢署已與總統府初步聯繫，作證的相關作業及時間配合馬英九時間。府方基於尊重司法，將配合調查，若有約談，馬英九會以證人身分到場。府方已著手研商馬英九赴地檢署的相關安排，但基於偵查不公開的原則，不做任何評論或透露細節。
低調謹慎 不考慮就訊
北檢指定檢肅黑金專組主任檢察官張介欽偵辦此案。但因案件具高度政治敏感性，偵辦對象甚至包括檢察官的頂頭上司檢察總長，因此包括北檢檢察長楊治宇與襄閱主任檢察官黃謀信均參與沙盤推演，要求辦案時務必嚴守程序規定與偵查不公開原則，以免造成不必要的誤會。
法界人士指出，馬英九雖有元首刑事豁免權，但因在本案中並非被告，檢察官仍可依法傳訊。而前總統陳水扁曾赴花蓮地檢署作證，北檢傳馬有例可循。
總統證詞 再傳黃比對
據指出，承辦檢察官在關說案爆發後，即積極蒐集特偵組新聞資料與相關媒體報導，近日更向總統府調閱官邸人車出入資料，並向特偵組與台北地方法院調閱「100特他61」案所有聲請監聽卷宗，幾乎已掌握所有書證。承辦檢察官為釐清黃世銘有無洩密，決定先行傳喚馬英九取得證詞鞏固案情，再傳黃比對說詞。
由於特偵組於今年9月5日簽結全案，黃世銘卻在簽結前的8月31日待特偵組結束訊問台灣高檢署檢察官林秀濤後，主動聯繫馬英九，並於晚間11時許冒著大雨赴官邸報告關說案情；翌日，馬英九又再次請黃到官邸說明案情，外界質疑黃在案件偵結前面報馬英九涉嫌洩密。
尚未簽結 夜奔府報告
據悉，檢方希望從馬英九口中查知馬與黃世銘究竟見了幾次面？黃世銘報告內容為何？是否有出示筆錄、監聽譯文等偵查資料？釐清黃世銘在全案尚未簽結前，向馬英九報告的究竟是刑事案情或行政不法資料。
關說疑雲爆發後，外界對特偵組偵辦手法質疑聲浪不斷，認為特偵組監聽A案辦B案涉嫌濫權監聽；而特偵組在新聞稿揭露監聽譯文、黃世銘夜奔總統官邸報告也遭質疑涉嫌違反《個人資料保護法》、《通訊監察與保障法》及洩密等刑責，北檢已接獲20餘起告發案件併同處理。