流感疫苗今年優先接種對象包括：年滿6個月到小學六年級的兒童、65歲以上老人、不限年齡的重大傷病患者、罕見疾病患者、60到64歲心肺疾病與糖尿病等高危險群民眾、居住安養與養護機構者、醫事及衛生防疫人員、禽畜業及動物防疫相關從業人員等。
疾病管制署指出，如果公費疫苗有結餘，將於明年元月1日納入第二波候補對象：50至60歲具高風險慢性病患等。
疾管署表示，符合資格的民眾，可自行或攜帶幼兒前往衛生所或約3000家標示有公費疫苗的醫療院所施打；國小學童將陸續安排學校內接種，家長僅需等候通知接種即可；另外，社區也有不定時安排接種站，民眾可留意衛生局公告資訊。
疾管署今年採購逾304.7萬劑，採用世界衛生組織建議採用的三價流感疫苗，也可預防2種A型、1種B型流感疫苗。公費補助接種對象，使用疫苗免費，掛號費、診察費、注射費或空針費需要自行負擔，但今年幼兒比照老人免付診察費。
疫苗製造藥廠新推出四價疫苗，可預防2種A型、2種B型，供民眾自費施打，每劑四價疫苗本身約新台幣950元。
另外，75歲以上未曾接種過23價肺炎鏈球菌多醣體疫苗（PPV23）的長者，可接種這項疫苗；民國97到100年出生滿兩歲尚未接種13價結合型肺炎鏈球菌疫苗（PCV13）幼童，也可接種。這兩款肺炎鏈球菌疫苗均可與流感疫苗同時接種。