金門縣長李沃士、交通部航港局長祁文中、大陸福建省政府交通廳副廳長馬繼列、福建省台辦處長陳德津等兩岸主管單位代表下午在金門水頭碼頭見證第1000萬旅客後，到金門大學參加「小三通回顧與發展交流座談會」，國民黨立委楊應雄也加入。
金廈小三通出入境人數在民國100年達到高峰，全年147萬4000多人次，去年減少到145萬8000多人次。
今年以來小三通出入境人數每月下滑，移民署國境隊統計今年1到8月88萬2100多人次，較去年同期減少9萬7000多人次，減少率9.9%，其中大陸旅客21萬多人次，較去年同期減少6萬7000多人次。
金門大學國際暨大陸事務系助理教授邱垂正指出，小三通出入境人數突破千萬，是兩岸聯運交通的奇蹟，使得兩岸關係更緩和，並提供兩岸直航參考，但小三通去年負成長，今年的狀況更嚴重，大陸遊客流失3成。
他表示，面對兩岸直航、台灣離島機票調漲，使得小三通面對邊緣化的嚴重挑戰，且突破千萬的流量中，台灣遊客高達800多萬人次，顯示小三通都是台客運用，希望大陸不要口惠而實不至。
李沃士表示，小三通之後，金門變成兩岸交流最前線，未來也可能成為核心地區，為兩岸做出更多貢獻；小三通負成長必須面對的課題，硬體建設與兩岸行政程序需不斷突破。
馬繼列表示，小三通是福建與台灣3個離島的聯絡通道，福建省政府立場是繼續下去，過去金門的政治人物對此著力很深，但大陸透過一定管控機制管理小三通航線，不能全面開放，讓航商有一定的利潤，才能確保每家航運公司保持營運。有賺錢就開放更多航商經營。
他指出，小三通航運公司沒有一家虧損，如果虧損是經營不善，大陸曾估算航運票價，成本約40多元人民幣，現在票價130元人民幣確實偏高，應降到新台幣500元，雙方還要繼續努力。
馬繼列也希望，未來將開發漳州與金門間航線，也支持福建黃岐與馬祖航線、福建東山島到澎湖間航線，擴大小三通的運能。
祁文中認為，小三通應增加旅客誘因，提高旅客消費力、增加旅客停留時間，面對未來的變化，兩岸交通主管單位應可透過協商，進行議題對談、交換通航意見。