包括美、英、以色列等國專家在內的調查人員，25日對購物中心大樓展開搜查和清理，他們的工作從驗明被擊斃恐怖分子的身分，到檢查暴徒是否埋設詭雷等。當天，大樓內仍不時傳出槍聲，政府方面解釋，安全部隊每進入一個未知的領域，為避免遭到伏擊，會先開槍示警。
肯亞總統甘耶達宣稱，這起事件造成67人喪命，包括6名安全部隊士兵和5名恐怖分子。由於尚有許多人下落不明，預計死亡人數還會攀升。
除了被擊斃的5名恐怖分子，肯亞當局另外逮捕到11名疑似涉案的嫌犯。英國外交部證實其中1人是索馬利亞裔英國人，現年35歲，他因形跡可疑，加上臉上有不明外傷，在奈洛比國際機場遭到扣押，當時他正準備登上一架土耳其航空公司班機。
這起震驚國際的攻擊事件發生在21日上午，恐怖分子衝進西門購物中心，投擲手榴彈並向購物客人和工作人員開槍。暴徒隨後挾持若干人質，與肯亞軍警展開對峙。肯亞安全部隊23日發動強力攻堅，總統甘耶達24日宣布事件落幕。不過整起事件仍有不少疑點尚待釐清，調查人員希望能從被捕的11人口中，得到一些答案。
策畫這場攻擊的索馬利亞青年黨透過推特稱，肯亞政府軍因無法解決大樓內的「聖戰士」，用炸藥炸毀部分樓層，造成多達137名人質被埋在瓦礫堆底下。青年黨還稱，政府軍自知不是聖戰士的對手，施放化學武器來結束對峙。肯亞政府則駁斥這項說法是一派胡言。
有報導稱，2005年倫敦地鐵爆炸案凶嫌之一的遺孀、有「白寡婦」之稱的露絲威特，參與了這次攻擊，青年黨發布聲明稱，這次行動的聖戰士全是男性，青年黨人才濟濟，「不需要讓姐妹們在戰場上冒險」。