非核能源政策 內政挑戰
梅克爾在前兩任內因穩定處理歐債問題及低調的領導風格，廣受德國選民認同，最漂亮的政策則屬將該黨原本並不支持的反核政策，一舉因日本福島核災的教訓，全數納入基督教民主聯盟的政綱，將德國引入一個真正的綠能國度。不過，第三任總理任期一開始，她必須設法推動規模達五千五百億歐元的能源改革政策，讓原本仰賴核能的德國逐步邁向以風力和太陽能為主的非核能源。梅克爾在選前曾表示，修訂再生能源法是連任後的首要任務。
力保歐債危機不再上演
此外，她還必須確保歐債危機不再上演，雖然部分曾陷入危機的歐洲國家經濟狀況有所好轉，但希臘政府仍欠債達三千億歐元，顯然無法獨自走出危機。而德國本身的經濟雖較多數歐盟國家為佳，但德國政府從聯邦到地方也是負債累累，國債高達二兆一千億歐元，每年再怎麼撙節，預算仍是入不敷出，若干邦甚至負債到瀕臨破產。再加上德國人口老化、出生率又偏低，政府是否該以增稅手段來改善財政缺口，也是頭痛問題。
與宿敵社民黨左右共治？
梅克爾選後可能被迫與宿敵社民黨再次籌組左右共治大聯合政府。儘管梅克爾首任即曾和社民黨組成黑紅政府，但當時社民黨遭逢慘敗，黨內領袖都同意入閣，確保聯合政府維持一定紀律。此次社民黨恐因是否再度與基民盟合作而陷入分裂，包括總理候選人史坦布呂克、極可能在四年後挑戰總理寶座的北萊因西發里亞邦邦長克拉芙女士等重量級人物，都表明無意進入梅克爾政府。