馬王共治成局，馬跛腳難翻盤
因應如此巨變，馬並無讓步跡象，目前已訴諸「公職與黨職切割」策略，排除王金平參與國民黨活動，例如每週舉行的總統府5人黨政協調會議、9月29日國民黨19全大會、10月初國民黨中評會。但只要屬於公職活動，例如總統府月會、立法院院會、10月國慶籌備會等等，國民黨並不能阻止王金平出席。
在抗告尚未成功之前，馬必須接受與王共治的現實，但王既已被排除在國民黨的決策之外，爲了增加政治籌碼，只能更加廣結善緣，主持議事也將更加中立化，使馬要遂行政策意志更加困難。在立法院9-12月會期，飽受爭議的服貿協議、核四公投、年金改革，恐怕都會因此面臨極大阻力。
9月11日國民黨撤銷王金平黨籍，TVBS民調發現，馬滿意度跌到歷史新低11%，比原本13%還低。當問到是否贊成國民黨撤銷王金平黨籍時，只有17%贊成，55%反對。即使只問國民黨選民，也只有37%贊成，47%反對；中立選民反應更強烈，只有20%贊成，60%反對。蘋果日報民調問得更直接：「關說案風波爆發至今，馬和王兩人，你支持誰」？結果發現支持王高達65.7%，支持馬只有21.7%。
馬發動斬王卻自陷困局，不但民調慘跌到歷史新低，最後還被迫與王共治，殺敵八百卻自損三千，已經註定淪為跛腳總統。馬民調低到11%，已經很難主導任何具有爭議的重大法案，如果不能接受失敗，轉與王發展新的合作模式，在剩下的兩年多任期，恐怕會面臨令不出總統府、幕僚逐漸求去的執政窘境。
服貿卡在立院，王喊冤未杯葛
這次馬急於斬王，各界都歸因馬急於通過兩岸服貿協議，但王卻百般刁難，接受在野黨要求的「逐條審查、逐條表决」程序。服貿協議本文總共24條，外加附件一（服務貿易特定承諾表）和附件二（關於服務提供者的具體規定），其中附件一長達39頁，涉及各種產業部門+各種市場開放承諾，如果真搞「逐條審查、逐條表决」，原本照案通過的機率就很低，更不要說目前馬民調已經跌到歷史新低，又和立法院長王金平處於空前對峙狀態。
問題是，服貿協議能否通過，不但將連動到明年ECFA後續協商（包括多達數千項的兩岸貨品貿易協商、兩岸貿易爭端解決機制），同時也將連動到台星經濟夥伴協議(ASTEP)能否順利簽署。一旦服貿卡在立院，或修改幅度極大，幾乎可以斷言，明年ECFA後續談判必將全面停止。這不但是馬政府的執政失敗，也絕非大陸當局所樂見。
針對外界指控王「故意製造服貿障礙」，王大聲喊冤，表示服貿協議朝野協商時，連國民黨黨鞭也簽字同意逐條審查表决，豈能怪罪王一人？而且他對服貿協議的批評，主要針對行政部門（包括陸委會+經濟部）「決策專擅」、「聽不進外界意見」、「溝通嚴重不足」，並未針對服貿協議內容提出批評。
王以2010年ECFA在立法院審議為例，當時王與民進黨總召柯建銘在官邸足足研究2天，一度因為國民黨大黨鞭林益世反對，柯氣得拍桌大罵，最後雙方才達成妥協，讓民進黨暢所欲言，但最後放棄投票，ECFA全案才能順利過關。
事實上，早在8月下旬，王金平即樂觀表示，只要政府針對弱勢產業做好輔導和救濟，服貿應可克服爭議。他還特別強調，台灣的最大競爭對手是韓國，韓國已和45個國家簽署自由貿易協議，台灣却只和幾個中美洲小國+紐西蘭簽署協議，進度嚴重落後，對台灣十分不利。
王已經點出服貿陷入僵局的兩大主因：一是馬政府並未說明如何協助弱勢產業，導致相關廠商人心惶惶；；二是馬政府並未把服貿連結到台韓競爭，導致人民缺乏危機意識。王一下就點出服貿過關的兩大關鍵，顯然比馬要精明許多。
馬難主導局面，大陸須擴大交往
情勢惡化至此，馬已確定難以主導局面，但馬常自我感覺良好，繼續剛愎自用、與王硬幹到底的可能性甚高，一旦如此，台灣不但將陷入前所未有的憲政僵局，還將因為遲遲無法通過重大法案而陷入空轉。首當其衝的敏感議題，兩岸政策必然都包括在內。
面對即將浮現的馬王共治局面，大陸也將陷入空前的尷尬處境。長期以來，大陸對台決策溝通，向來以馬所主導的行政部門為主，立法院都是由馬透過黨政平台自行搞定，大陸並未與王金平深入交往。但如今馬已經難以一人主導政局，眼看服貿協議、設立兩岸辦事機構、ECFA後續協商等重大法案，都將因為馬拒絕與王合作，即將陷入癱瘓困境，大陸是否將另闢蹊徑，增加與王金平對話管道，將特別令人關注。
兩岸政策屬於對外政策，過去台灣對外政策也曾陷入決策整合困境，大多是由美國介入搞定，例如去年美牛爭議，最後民進黨放棄絕對零檢出，轉而接受歐盟與美國協商的Codex標準，背後即有美國的著力痕跡。同理，當國民黨陷入馬王分裂，導致兩岸重大法案難以通過，同樣作為大國的中國大陸，恐怕也必須仿效美國做法，開始發展多線接觸與遊說管道，才可能穩住兩岸繼續向前發展態勢。
果真如此，勢將導致兩岸交往策略的重大調整，亦即從完全集中於總統主導的行政部門，轉向跨部門的多元接觸，起先將擴及王金平勢力，然後也可能擴及民進黨交流派（尤其是謝系+新潮流）。
可預期的是，馬確定跛腳所導致的台灣政局多元化，將使未來的兩岸交往更加複雜多元。只要大陸認為必須穩住兩岸繼續向前的步伐，恐怕就要積極發揮決策整合的作用，調整兩岸交往策略，擴大更多交往對象，幾乎是無可避免的趨勢。