總統在接見中表示，從他上任以來，台日關係有很大的進展，雙方簽署許多協議，使得兩國關係呈現斷交以來最好、最安定的狀態。兩國的觀光客也可望在今年突破300萬人次。另外，台日簽署漁業協議，在國際間獲得好評價，總統表示，這使台灣跟菲律賓進行相關談判時能有好的參照模式，值得肯定。
總統並表示，台灣非常關心日本的核能政策，未來也希望雙方能在相關領域合作。總統：『(原音)最近我們看到報導，本來還在運轉中的(核)電廠因為歲修關係而停機，我們很想知道對日本能源，尤其電力供應會不會造成影響，包括電價或者(電力)供應會不會缺乏。我們也很希望在這領域能跟日本加強有關核能方面的合作，還有災害的防救。』
總統指出，台灣現在積極加入區域經濟整合的行列，希望提高參加TPP的機會；總統說，他了解日本正積極進行TPP的協商，還組成龐大的談判隊伍，他認為這相當值得學習，也希望未來如果有機會進行談判，再向日方請教。總統並呼籲台日能簽署經濟合作協議或自由貿易協定，相信這將對雙方都有益。