「花岡山遺址文物特展」展出文物來自花岡山遺址考古發掘成果，年代最早的展出文物是距今約4500年新石器時代中期東部繩紋陶文化遺物，最晚的是約60年前日治時期在台日人所遺留的生活器物，展出的人類生活遺物見證了5000年來，發生在花崗山這個獨特「活沙丘」的故事，不同時期的人類在這個沙丘上留下他們生活的痕跡，考古學家利用先進的科學技術與自身的智慧結合，為我們解開史前人類生存的非文字密碼。
來到展場有如通過時間的甬道，讓我們體會到古人在這塊土地上生存的智慧。當我們再次到花岡山運動公園活動時，我們將以全新的眼光觀看眼前的風景—「前有古人，後有來者；念天地之悠悠，破涕而長笑」。
2008年至2012年中研院研究員劉益昌先生等主持的考古團隊搶救發掘花崗國中新建校舍基地，出土生活遺物數十萬件文化遺物並有豐富的生活遺跡，顯示遺址文化遺留極為豐富多樣，考古團隊特別從眾多的遺物之中挑選出，完整且具代表性的文化遺物展示，以時間的脈絡為縱軸，涵蓋新石器時代、金屬器時期、日治時期三個不同時期文化體系，是一個瞭解人類文化發展進程與環境互動關係，是難得一見重量級的文化饗宴。
花岡山遺址位於花蓮市公園路東北側，美崙溪河口南岸的台地上。遺址所在範圍現為花崗山運動公園，美崙溪流經遺址北側，西側為花崗國中，東側隔著北濱國小、海岸路與海岸比鄰，海拔高度約為20公尺。
花岡山遺址首次發現為1929年，日籍學者移川子之藏、宮本延人於遺址上進行調查與小規模試掘，初次披露花岡山遺址遺物的文化特徵。1992年因花崗山運動公園中正體育館重建，國立史前博物館葉美珍女士等進行發掘工作，出土豐富文化遺物與甕棺等遺跡，葉美珍女士認為出土遺物風格屬於單一文化層，可以作為花岡山文化的代表。2007年因花崗國中新建校舍規劃涵蓋花岡山遺址範圍，由中央研究院研究員劉益昌先生等進行試掘評估，初步確認本遺址至少涵蓋日治時期、金屬器時期、新石器時代等不同階段的文化體系。
花岡山遺址因為地處河海交界處，各種魚、貝、蟹等水中生物在此棲息進食，提供豐富蛋白質養分的來源，間之水路交通便捷，古來吸引史前人群長期定居於此。最早債距今約5000年前即有大坌坑文化晚期的人群在此活動，4500年前新石器時代中期，繩紋紅陶文化時期就有人群來此定居於美崙溪出海口的砂壩上，過著以漁獵為主的生活，到了3000多年前花岡山文化時期，人們的社會結構與生活日趨複雜，除了製作極富美感塗紅彩的陶器和精美的玉器，進行貿易交換遍及全島以及台灣以外地區，花蓮特產閃玉（豐田玉）出現在千里以外的東南亞。