關說風暴讓國民黨籠罩在分裂陰影之下，國民黨主席馬英九16日在黨團大會中向黨籍立委喊話，表示國民黨要團結、要繼續推動改革。馬英九也再次強調，關說事件沒有陰謀、沒有鬥爭，只有意外。國民黨立院黨團書記長林德福轉述說：『(原音)馬主席特別提到國民黨一定要改革，而且一樣要繼續改革，這是很重要的前提；並且針對這次關說事件，說沒有陰謀、也沒有鬥爭。』
國民黨64名立委中有50人簽到，但是部分在立法院長王金平日前返國時前往接機的立委還是沒有出席，也有許多立委，像是廖正井、陳根德等人則是簽到之後就離去，更有立委在馬英九一到場就直接離席，實際上從頭到尾開完會的大約只有20多人。
另外，行政院長江宜樺日前表示，王金平捲入關說，若繼續擔任立法院長，恐怕有爭議，以及行政院已對沒有王金平的立法院有所準備；針對這些發言，呂學樟也當場要求江宜樺修正，江宜樺則解釋自己的本意並非如此，相關報導是媒體誤解。