花蓮地區文旦柚種植面積約1600公頃，產地主要集中在瑞穗鄉、玉里鎮等中南區鄉鎮。瑞穗鄉農會總幹事魏清河指出，早年花蓮的文旦柚因果樹樹齡還年輕，所生產的文旦柚品質確實比不上台南麻豆文旦，曾出現冒名麻豆文旦的情形。
花蓮縣政府農業處長張智超表示，近10年來花蓮文旦柚果樹已「長大成人」，所生產的文旦柚品質普遍大幅提昇，品質已不輸麻豆文旦，尤其是樹齡25年以上的老欉文旦，一顆約400至600公克，體型雖不大，果肉豐富多汁，口感、甜度都是上選。
對於外傳花蓮文旦被拿來混充麻豆文旦銷售的情形，張智超說，如果花蓮文旦品質不好，大概也不會有業者願意拿來混充假冒，正因為花蓮文旦品質不輸麻豆文旦，才會出現這種假冒的情形。
張智超表示，花蓮的瑞穗鶴岡文旦和玉溪地區文旦於3年前，約出貨150公噸銷往上海，獲得當地消費市場好評，全數售完，凸顯花蓮文旦的品質受到肯定。
花蓮縣府為協助花蓮柚農增加收益，並減少被大盤商價格剝削，近年來全力輔導建立花蓮文旦自有品牌；張智超說，這項努力已逐漸看到成果，就像花蓮西瓜現在受市場重視一樣，花蓮文旦也將在自有品牌的加持下，打出自己的知名度和市場。