一、特偵組事證只有對王柯監聽記錄，以及約談部份當事人記錄，完全沒有直接證據，不但遭到涉案三人全面否認，甚至包括承辦檢察官林秀濤也認為特偵組扭曲她的陳述本意，形同濫權解釋。
二、特偵組以簡訊通知，表示將召開「重大司法風紀事件結案記者會」，請媒體「切勿錯過」，如此大張旗鼓，仿佛將宣佈偵破重大弊案。但雷聲超大，雨點卻微不足道，特偵組顯然自知證據不夠充分，不敢直接提出訴訟，只敢移送「不敢打老虎」的監察院處理。如此曲折做法，顯示用意不在真正辦案，只在提出雷聲超大的政治警告。
三、特偵組要對立法院長申請監聽，是何等敏感大事，不可能不事先向國安高層報備，檢察總長黃世銘表示在調查本案之前，曾事先告知馬總統，等於承認馬不但早已知情，而且馬還批准對王訴諸監聽手段。
四、特偵組記者會之後，儘管因為證據力不足，曾勇夫力陳「絕對清白、要求對質」，馬卻一面倒採信特偵組說詞，不讓法務部和特偵組有對質機會，立即要求曾勇夫下台，急於造成難以挽回的既成事實。
馬劍指王金平，曾柯只是陪葬
曾勇夫辭職之後，馬更以迅雷不及掩耳之勢，立刻以國民黨主席身份，責成國民黨秘書長曾永權通知國民黨不分區立委王金平，儘快結束馬來西亞度假回國，說明涉及司法關說之事。
事發至此，大家才恍然大悟：原來特偵組的大張旗鼓，只是爲了敲山震虎，是爲了馬英九的最後出手，鋪設足以威懾政敵的權力舞台。司法關說案固然涉及黃世銘與曾勇夫的長期恩怨，但在兩位部長的恩怨底下，其實還潛藏著國民黨兩大天王的空前交手，曾勇夫+柯建銘只是碰巧陪葬而已。
畢竟，早從2005年7月國民黨主席之爭開始，馬王兩人互不對盤，早就是政壇的公開秘密。競選黨主席期間，馬陣營以「黑金」、「賄選」暗諷王金平，挺王的雲林縣農田水利會長張輝元反罵「馬英九不是人」，雙方開火毫不手軟。選後馬多次表示將預留第一副主席給王金平，王始終予以拒絕。
爲了營造黨內團結，馬不得不在2008年挺王續任立法院長，2012年也基於同樣理由，特別為王修改黨章，讓王續任第三次國民黨不分區立委，繼續擔任國會議長，但兩人關係始終貌合神離，只是一路走來、相安無事而已。
儘管馬已經執政五年多，由於謹小慎微+法匠性格，始終謹守行政立法界限，儘量不侵犯王金平的院長職權，久而久之，王也習慣國會擁兵自重，越來越不把馬家軍放在眼裡。馬的孤芳自賞+政治潔癖，相對於王的善於協調+雨露均沾，使王得以逐步擴展出脫離馬控制的國會分配王國，不但把無黨籍也收編在內，甚至連民進黨立院總召柯建銘也成為拜把兄弟。
在馬的第一個總統任期（2008-12），馬在大選以220萬票差距大勝民進黨，連帶使國民黨立委搶佔將近四分之三席次，包括王金平在內的國民黨立委，對馬的超高聲望多表敬畏，立法院幾乎只是總統府+行政院的橡皮圖章。
但進入馬的第二個總統任期（2012- ），隨著美牛、油電雙漲、證所稅、年金改革、12年國教、核四公投、服貿協議等等不得人心政策的陸續出籠，馬的民調迅速跌到歷史低點，國民黨立委對馬的敬意已經消失殆盡，原本就與馬不對盤、長期擁兵自重的立法院長王金平，自然也採取冷眼旁觀姿態。
問題是，兩岸服貿協議眼看就要在明年元旦生效，最晚必須在立法院本會期通過；核四公投如要避免與明年七合一選舉撞期，也必須在本會期通過提案。但相較於馬的心急如焚，王仿佛事不關己，甚至還呼應在野黨主張，同意服貿協議必須「逐條審議、逐條表决」，表决之前必須舉辦16場公聽會，等於讓服貿過關添加空前障礙，馬看到「王不但不幫忙，還倒添亂」，氣在心裡卻無可奈何，遠在美國、通曉台灣政情、最了解馬的金溥聰，想必也痛感義憤填膺。
也難怪資深媒體人周玉蔻看到馬的決然出手，凸顯出如此強烈的戰略意圖，會如此評價：「這對馬是一次空前考驗：若處理了王金平，會被認為是鬥爭；但若不處理，馬就不只是軟腳蝦，還可能變成沒腿的人」。馬所面對的嚴峻情勢，可想見一般。
馬擒賊先擒王，直掐國會咽喉
握有情治大權的馬總統，早就熟知王金平的相關爭議案件，過去之所以遲未動手，只是因為大家相安無事，情勢沒有如此迫切而已。如今馬因為服貿協議+核四公投的截止日期就在眼前，不得不提前下馬威，威嚇王院長必須及早歸隊，在今年底前率領國民黨立委通過兩大爭議法案，實在是情勢所逼。
問題是，馬一方面要對王立威，另一方面又要爭取王力挺，二者之間的力道拿捏，政治算計也要恰到好處，否則很容易導致王不歡而散。幾經考慮，馬決定不從涉及經濟利益的爭議案件下手，改由必然引發輿論憤慨的司法關說案下手，正是兼顧了「壓力最大、停損最快、化敵為友最容易」的三大原則。
首先是壓力最大。司法關說案涉及人民最關切的「皇后貞操」，黃世銘的公眾形象又是如此嫉惡如仇，揭發王涉及司法關說案，可讓輿論壓力立刻撲向王，使王的國民黨不分區立委資格備受爭議。馬身為國民黨主席，不管是要求王停權接受調查，或是取消王不分區立委資格，都將擁有判定王政治生死的絕對權力。
其次是停損最快。司法關說案的最大當事人曾勇夫，馬在第一時間就逼他下台，等於已經停損大半。由於本案並非經濟關說案，並沒有對價關係人，全案在曾下台之後，已經沒有蔓延擴大可能，完全在馬的掌控之下。
最後是化敵為友最容易。王是否涉嫌司法關說案並非本案焦點，關鍵在於特偵組大張旗鼓，已經足以敲山震虎，造成王的政治傷害，足以造成王的不分區立委資格備受爭議，使王完全陷入被動局面。對王來說，本案純屬政治案件，爭議可大可小，國民黨處罰的嚴重程度，完全取決於黨主席馬英九的仁慈與否。
筆者認為，面對突如其來的司法關說案，面對瞬間高漲的抗議聲浪，面對如此懸殊的籌碼對比，向來通權達變的王金平，已經毫無招架之力，只能選擇棄械投降，向馬表達絕對效忠，才能繼續保住權位。馬對王的招安過程，也必然採取「聽其言、觀其行」的嚴審態度，能否配合馬推動服貿協議+核四公投過關，正是兩大考驗指標。
馬出其不意，攻其虛門，使原本與馬並肩而立的王院長，突然全面陷入被動，不得不俯首稱臣。馬擒賊先擒王，拿下最難擺平的王金平，有如佔領立法院的戰略要塞，直掐國會咽喉。國民黨立委眼見王也不得不向馬歸順，見識到馬也有訴諸威嚇的黑暗面，未來即使要造反，恐怕也會低調多了。