軍方︰保留部分 餘將遭立院刪除
國防部官員也說，在國防部「國軍生產及服務作業基金」內，也有「軍事監所事業」在內，未來在監所服刑人全數移交後，基金內有關軍事監所事業的經費，也將進行清算後繳庫。
根據國防部一○三年度預算書顯示，除人員薪餉是另行編列外，軍事院檢單位明年度共編列九五三○萬五千元預算，主要內容包括：軍事行政業務編列三五六七萬九千元，後勤資通業務三六○六萬四千元，軍事人員經費一八二七萬一千元。
軍法人員在薪餉中還包含各級軍法加給，根據預算書顯示，軍法人員勤務加給分為四類，最低的書記官每人每月三二○○元，最高的是將官、上校軍法官，每人每月八九○○元；至於符合領取軍法人員勤務加給的人數，預算員額達到三六○人，軍法人員勤務加給的預算總數為二五一八萬五六○○元。
官員指出，軍審法修法已在第一階段移出部分在押軍犯，第二階段預計在明年初進行，屆時無論是在軍事監獄服刑人或是軍事看守所在押嫌犯，都將全數移由法務部處理。而即使軍事案件全數移交司法，軍法人員仍依法享有軍法加給，即使是調任軍法官以外職務，其年資待遇仍按軍法官規定發放。