中央災害應變中心上午召開康芮颱風第6次工作會報，內政部長李鴻源主持。他說，這次颱風應變期間，部分地方政府，尤其是嘉義縣，在處置應變作為方面非常消極，應予檢討。
嘉義縣政府回應指出，依據中央氣象局資料顯示，28日嘉義縣雖不在康芮颱風的警戒範圍，但嘉義縣仍於晚上10時30分開設二級災害應變中心，相關單位陸續進駐，隨時注意颱風動態，做好各項防災整備工作。
縣府表示，嘉義地區今天清晨因瞬間超大豪雨造成淹水災情，縣府於上午7時30分緊急宣布停班停課，災害應變中心提升為一級開設，第一時間掌握各鄉鎮市災況，指揮調度水利、警消進行搶救工作，防災應變能力不容置疑。
不過，嘉義縣上午雨勢強，各鄉鎮市多處道路積水影響行車安全，家長仍冒雨送小孩上學，縣府上午臨時才宣布停班停課，民眾隨即又得再接一次小孩，大罵縣府應變太慢。
縣府說，嘉義縣雖未達停班停課標準，但因瞬間大雨造成排水宣洩不及，各鄉鎮市和主要道路清晨起陸續傳出淹水災情，縣府考量民眾和學童上班、上下學安全，緊急宣布停班停課，造成民眾不便，深表歉意。