黃秀珠被控在2006年至2010年間擔任台中縣議員任內，涉嫌指示助理偽造文書，以人頭向縣議會報假帳，將助理的薪資匯進自己的戶頭後，再部分發放給助理，餘款皆挪為己用，侵占入己，涉挪用助理費共新台幣354萬2404元。
判決書指出，黃秀珠指示姚姓助理，盜用其他助理的印章，製作「茲委託議員黃秀珠代領委託人ｏｏｏ擔任議員助理每月之助理費用新台幣四萬元整」委託書、不實的助理名冊、聘書等，傳真到台中縣議會詐領助理薪資、春節慰問金等。
台中地院法官審理後認為，黃秀珠擔任民意代表，竟貪圖利益，侵占公用助理薪資，以人頭助理或短報助理薪資方式詐領助理薪資， 今天以侵占公用財物罪、利用職務機會詐取財物罪，重判黃秀珠12年8月徒刑；偽造文書罪部分判刑9月，得易科罰金27萬元，另褫奪公權5年，追繳不法所得。而姚姓助理依偽造文書罪被判刑8月，緩刑2年，全案可上訴，
黃秀珠得知一審被重判後，發出聲明稿表示，這項判決充滿偏見與成見，比前行政院秘書長林益世的7年4月還重，顯見法官是抱持「有罪判決」的立場，有明顯政治干預司法的痕跡。
黃秀珠表示，助理費完全使用在助理支出，只是當時沒有讓助理一一簽名，但是絕對沒有一毛錢進入她的口袋，為捍衛清白，她一定上訴到底。