消費者文教基金會指出，「鐵路法」第26條規定，「國營鐵路運價率之計算公式，由交通部擬訂，報請行政院送請立法院審定之；變更時亦同。國營鐵路之運價，按前項公式計算，由交通部報請行政院核定實施；變更時亦同。」
同法第35條，「地方營及民營鐵路之運價，由交通部核定，增減時亦同。」消基會據以主張，高鐵的費率變更門檻較台鐵低，更應由交通部負完全把關責任。
但消基會發現，雖然高鐵虧損新台幣500億元以上，卻已連2年盈餘，去（2012）年稅後淨利已35.76億元；又對自己員工票價自肥，只有一般票價的2.5%，等於台北至高雄單程只要37元，比媒體報導台北至高雄的單程票價10月1日起將漲140元，以及台北捷運從台北車站到淡水站的50元都低。
消基會質疑，高鐵是準特許、獨占企業，基於台電於6月下旬公告取消對公共運輸用電優惠，宣稱一年增加電費1.4億元；但消基會發現高鐵成本最高是占34%的折舊費用與占27%的利息費用，電費僅占3.8%，影響性低，不信任高鐵的漲價說法。
消基會主張，高鐵想漲價前應先從自身改革做起，例如4月25日自清晨6時許起到上午11時30分停駛，是營運以來最嚴重的停駛事件，至今未說明原由？
又如對持2000元購台北到高雄票1490元，自動售票機仍只會找10枚50元硬幣與1枚10元硬幣。以及早鳥票數量過少，得碰運氣外，還限定28天前開賣。
消基會進而呼籲，交通部若認為高鐵6年未漲，早已不敷營運成本，民眾薪資水平卻是10多年來不漲反退，「難道政府的決策只會偏袒企業嗎？」難怪會遭媒體譏諷為「放任漲風」。