位於台南市六甲區的台南軍事監獄，307名軍囚中有254人適用於軍審法新制第一階段，其中41人被移至台南監獄，33人被移至台南分監，前者因有1人已事先被送到南監，今天共73人移監。
台南監獄的40人上午9時48分左右分乘2輛囚車從台南軍監出發，半小時後，台南分監的33人也搭上囚車啟程，所有軍囚在上午11時前抵達台南監獄及台南分監。
台南地檢署則出動4名檢察官及4名書記官，到台南監獄完成人別詢問及換發指揮書，確認移監軍囚身分及從軍事檢察署接手軍囚的程序。台南市警局則派出戒護車隊前導車及警員協助交通疏導，軍囚運送途中的戒護由憲兵負責。
因國防部及法務部保密工作到家，媒體事先不知軍囚移監時間，多家媒體清晨陸續趕到台南監獄外守候，但南監大門深鎖，嚴禁外車進入，直到上午7時許，南監人員上班才見車潮，獄方也開放媒體到南監檢查站外拍攝軍囚搭車入監，過程平順。