台灣司法史上最大規模的移監行動15日上午展開，254名軍事犯從台南軍事監獄移監到全台11處矯正署監獄。清晨6時20分左右，首批移監的軍事犯搭乘台北監獄的囚車離開台南軍監，之後每隔一段時間，就有車隊駛離軍監大門。
戒護車隊由荷槍實彈的警方與武裝憲兵組成，由台南市警察局前導，後方是接管監所當地的轄區員警，囚車則夾在武裝憲兵之間，另外還有運送公文的廂型車及運送受刑人個人物品的大貨車，最後再由警車押後，就連執行交管的員警也穿著防彈背心，全程嚴陣以待。
移監名單中，較受矚目的包括涉及拉法葉艦軍購弊案的海軍前上校郭力恆、涉及共諜案的陸軍前少將羅賢哲、涉犯貪汙案的陸軍六軍團前指揮官程士瑜、前憲兵司令何雍堅等人。將官在移監到所屬監獄後，將不再享有獨居房等特殊待遇，牢房將比照一般受刑人規格，並依缺工比例安排勞役。
至於國防部僅存的台南軍事監獄，在完成移監作業後將面臨裁撤，未來可能移交給法務部矯正署或做其他軍事用途。