南市國中特殊身分學生佔全體學生數9.54%，市議員邱莉莉認為這些學生在親師溝通管道大部分有所不足，勢將影響超額比序分數。因此要求教育局對各校特殊身分學生的輔導須強化，並專案統計其生涯發展規劃超額比序積分，向市議會提出報告。
市議員邱莉莉指出，適性輔導是12年國教的核心精神，目前全國有6個免試區將其納入超額比序積分項目，包括桃園區、宜蘭區、嘉義區、屏東區、金門區和台南區，其中台南市的生涯發展規劃建議最高分數可達6分，與「我的志願」相符者得兩分、與「家長建議」相符者得兩分、與「輔導小組建議」相符者得兩分，也就是說三者都有共識，即可拿6分，任兩者有共識得4分，都沒有共識僅剩2分；每級分的分數落差其實比獎勵紀錄、幹部任期、社團參與、服務學習等多元學習表現還大，卻鮮少獲得重視。
根據教育局統計，台南市62所國中47,614位學生中，屬於特殊身分學生共有4545位，分別是隔代教養家庭者有497位、單親家庭者有3121位、新移民家庭者927位。其中人數最多的是永康區永康國中345位，其次為東區後甲國中264位、新營區南新國中256位、歸仁區歸仁國中253位、東區崇明國中251位；至於比例則以東山區東原國中41.53%最高，再者為官田區官田國中32.61%、北區延平國中28.9%、白河區白河國中28.15%、北區成功國中26.28%，這些學校的特殊身分學生或人數多、或比重多，但其輔導資源並無較多。
邱莉莉指出，自一百學年開始，教育局發給國中新生「生涯輔導紀錄手冊」，要幫助學生紀錄性向、志趣，當然也做為超額比序生涯發展規劃建議的積分依據，然而特殊身分學生由於成長環境不同於一般家庭，與導師或輔導教師的親師溝通可能沒有密切連繫，加上目前各校專任輔導教師一視同仁都只有1名，導師又僅肩負初級生涯輔導的角色，特殊身分學生的生涯發展建議分數能否順利獲得6分，或者家長將無法得知學生的期待感與價值觀，問題頗令人憂心。
邱莉莉表示，若生涯發展建議沒有計入超額比序積分項目，或許教育局的改善期程還可容緩，但明年上路的12年國教將使特殊身分學生的親師溝通難題轉化為分數落後，衝擊是立即且明顯，教育局應對特殊身分學生在12年國教的輔導多加心力，其和一般學生的超額比序積分差異也要備妥分析資料，向市議會提出專案報告。