教育部長蔣偉寧表示，一○三年各招生區免試比率須達七成五，一○八年要到八成五，各校免試比率也至少要二成五，希望不要只關注明星高中，全國高中校長會議是大家腦力激盪的場合，才會要求所有校長都出席，建中和北一女校長缺席「很可惜」。
教育部國教署組長李秀鳳說明，教育部是透過各地方教育局邀請校長親自出席，據悉，建北兩位校長原有報名，卻擬由教務主任代理，遭教育部拒絕後即逕自缺席。
建中秘書葉昭松表示，建中校長陳偉泓八月二日就因公赴日本參加學術研討會，緊接著帶領學校樂旗隊在日本參加世界樂旗大賽，預計八月十二日才會返國。北一女秘書江麗玉也說，北一女校長張碧娟原本規劃八月後退休，早與家人排定暑假前往歐洲旅遊，後被教育局慰留續任，事前已向教育局及全國高中校長會議報備核准。台北市教育局也表示，兩校校長皆有事先報備及請假。
會中有多位校長質疑，十二年國教配套如各校特招和免試比率，迄今未定案公布。教育部次長陳益興表示，近日內會核定。