另外，外界質疑各縣市加強捕抓流浪犬打疫苗後，仍放入收容所，可能引發收容過量，反而會安樂死更多狗；並傳出沒有收容中心的雲林縣，上週處理500隻狗。
行政院農業委員會畜牧處說，全台22縣市收容中心可收容7000隻，至昨天收容6335隻，在養量仍未滿，但各縣市情況不一，個別縣市有吃緊情況，其中雲林縣確實一直沒有收容中心，積極協調地方政府解決中。
關於有動保團體質疑台中市宣布禁止認養犬隻，引發網友塞爆市長信箱表達抗議。畜牧處說，台中市今天發新聞稿做出回應，希望民眾先不要到私人收容所收容，因為不確定是否都已施打狂犬疫苗；公立收容所仍會接受民眾認養犬隻。
外界同時傳出，推動工作犬概念以提高認養率的台南市，近來犬隻認養率持續提高，因為有宣傳公立收容所犬隻都有打疫苗，打過後被咬不會染病，還會保護主人抵禦染狂犬病鼬獾；因而民間有人提議流浪犬施打疫苗後，不要再關進收容中心，處於原地形成防禦網。
台南市政府也提供資料佐證7月收容876隻，認養492隻（認養率高達56%）；其中7月中到月底認養271隻，8月1日一天就認養了28隻，持續提高中。
就此，畜牧處僅先說明，因為狗打狂犬疫苗須一年打一次，若放回原地，不能掌握流浪犬能否持續施打。
畜牧處資訊補充，2012年全台公立收容所的認養率為28.7%，原本預計今年要提高4個百分點，到32%多；而今年1到6月全台認養率已經達到43.25%，且台中市一直是表現良好的縣市，今年至6月認養率已達46.26%，高過全台認養率。