海軍司令董翔龍接任行政院國軍退除役官兵輔導委員會主任委員，海軍司令職缺由副參謀總長執行官、海軍上將陳永康接任。
學者出身的楊念祖從國防部副部長轉任部長，他多次親上火線處理國軍爭議風波，諸如洪仲丘案及軍媒誤刊納粹照片等事件，楊念祖都在關鍵時刻挺身因應危機，展現勇於任事風格。
軍方高層透露，新任部長人選是由剛卸任的國防部長高華柱與總統馬英九充分討論後所得出的人選；馬總統考慮的人選名單都是在高華柱5年任內團隊中的軍職與文人，包括前後任國防部副部長。
針對外界對楊念祖領導國軍的疑慮，軍方高層強調，楊念祖擔任副部長近4年時間，早已與軍方打成一片，「跟其他文人不同，快出師了」。楊念祖在擔任副部長期間，每天早上甚至比高華柱還要早到辦公室，參與輿情會議。