市府總預算來自中央補助款部份竟遭追減48億元，佔總預算859億元的5.5%，市議員邱莉莉批評中央要1塊卻只給五毛，明顯看台南「卡細漢」，31日要求被刪減中央補助款的各局室主管，就被刪減原因與影響提出公開說明，並擬出因應之道，以免市政發展受嚴重衝擊。
邱莉莉說，市府所提出102年度地方總預算第一次追加減預算案的報告書，共提出48億2千萬元的中央補助款預算追減，即使加上17億元的中央補助款追加預算，關於中央補助款淨追減就達31億2千萬元，讓台南市今年度實質總預算規模大幅縮水，關於中央補助款的追減預算與科目，相關局室應該主動提出說明。
邱莉莉表示，她統計各局室遭追減中央補助款的預算科目共計46項，其中前5名追減大戶分別為工務局21億2千萬元、水利局18億8千萬元、教育局4億2千萬元、文化局2億7千萬元、農業局1億5千萬元；其中較引起側目是陷入狂犬病危機的台南市動物防疫所還追減1億5千萬元的中央補助款，包括提升公立動物收容所品質、畜禽動物疾病防治、水產動物疾病防治、動物用藥品生產與管理、一般性動物屍體資源化製再利用、加強動物保護、加強輸入動物追蹤檢疫、寵物及野生動物疾病防治等預算科目全都受到波及，另外台南美術館設置計畫也被追減1千8百萬元。
邱莉莉指出，中央補助款被刪減超過1億元的預算共有8項，分別為追減國小老舊校舍整建2億5千4百萬元、追減國中老舊校舍整建1億6千9百萬元、追減辦理「易淹水地區水患治理計畫」第3 階段102年度應急工程2億3千6百萬元、追減辦理易淹水地區水患治理計畫6億6千萬元、追減辦理沙洲復育、海堤修復工作計畫5億4千3百萬元、追減辦理竹溪親水綠廊營造計畫3億元、追減辦理生活圈道路交通系統建設計畫98-103期16億2百萬元、追減辦理歸仁區高鐵東側與交大歸仁校區聯外道路工程4億8百萬元，這些重大預算科目中央補助款不如預期，令人相當憂心市府沒有餘力可獨自負擔。
主計處長陳淑姿表示，中央補助款減少有部分是業務轉由中央直接承辦，如水利局治水工程轉第六河川局接手，有的則是代辦經費之故，有的則確實是中央未給予補助，市府會繼續努力爭取。水利局長李孟諺則說，追減2.36億的易淹水應急治水工程，是因水利局提報4.5億元向中央爭取，雖只獲2.1億元核定，但已是全國之冠，另6.6億元的易淹水治理經費由第六河川局執行故無須納入預算，市民權益未受影響。