關懷生命協會常務理事楊憲宏抨擊，教育部、海生館及海景公司，根本沒有考慮外海水溫變化多且遠低於海生館大洋池，也沒有接納環保團體建議野放鯨鯊前應設中繼站，讓牠有緩衝適應期間，結果害牠慘死，也使台灣未善待野生動物的醜名傳遍全球。
教育部終身教育司代理司長黃月麗表示，海生館已將鯨鯊野放調查報告送進教育部，但報告中只針對野放當天檢討，教育部要求包括野放前的規劃與專業人員參與部分也須說明。
海生館表示，野放過程絕非「棄養、虐殺」，已模擬可能的風險，鯨鯊兩度洄游擱淺，實在是過去野放鯨鯊未發生過的經驗。海生館產學合作中心主任李展榮表示，野放前經歷過二次演練，根據演練結果探討各項可能缺失，當天圍捕作業及運輸非常順利，卻無法預期野放後鯨鯊的行為，已經進行完整的檢討報告，對於動保團體指控予以尊重。