曹金生說，首先是部分媒體指洪仲丘疑似生前被灌水、虐殺，拿急救病歷資料誇大其辭，經專案小組調查，與事實有很大的出入，將交由法醫研究所做鑑定。
其次，曹金生否認有集體虐殺的事實，他指出，在洪仲丘悔過與做體能操練時與現行法規不符，但只有一個被告涉嫌施虐致死，一些媒體以聳動的報導造成社會不安，請大家給專案小組一個辦案空間，將徹查到底。
對於立委指269旅禁閉室的鏡頭被移動，經軍事檢察官調閱6月28日至7月3日的監視器畫面，沒有人為移動。
曹金生並對有人涉及湮滅證據罪指出，在事發後已與桃園地檢署配合，並到269旅採證，對於疑似簽賭，也成立共同聯合調查平台，徹查到底；此事件發生至今已19天，將戮力調查，還原真相。