為能確實掌握服貿協議對兩岸經濟與產業之影響，經濟部委託中經院針對服務貿易協議之實際開放程度，對我國總體經濟及服務產業之影響進行量化評估分析。評估報告結果顯示，服務貿易協議生效後，我國對中國大陸服務輸出值約增加4.02億美元，成長37.2%；自中國大陸的服務業輸入值增加約9200萬美元，成長9.08%。
在產值及就業需求之效益上，報告指出服務貿易協議對我國服務業產值具正向成長效益，估計總產值將增加約3.9億至4.28億美元，成長幅度平均介於0.10至0.11%間。其中商品買賣業的產值增加最多，約可增加1.35億至1.43億美元之間，成長0.17％，而空運業產值估計約成長0.55%，產值增加約3500萬美元左右，成長幅度最大。
至於對就業需求之影響方面，報告預估服務貿易協議對我國服務業就業亦有正向效益。服務業總就業人數估計約可增加1萬1380至1萬1 923人，總就業成長幅度約為0.15~0.16%。
中經院院長吳中書指出，自由貿易協定(FTA)把門打開後，維持目前狀況會有這些效果，但進一步拓展或是外部效益發揮，效果會比較大。以韓國為例，韓國在與南美洲小國簽FTA時，剛開始效益很少，但10年後，成長倍數達10倍以上。
經濟部長張家祝強調，服貿協議效益雖不如預期，但是台灣與國際接軌重要步驟，如果台灣跟大陸貿易不能正常化，台灣不可能跟其他國家簽FTA或加入TPP等區域經濟整合。