懲處27人規模最大
針對這起震撼國人的下士被操死案，國防部一口氣懲處七名將官，除李翔宙之外，還有陸軍司令部政戰主任曾有福中將申誡一次、陸軍六軍團指揮官陳泉官中將記過一次、六軍團參謀長楊海明少將及政戰主任簡士偉少將各申誡一次。另５４２旅旅長沈威志少將記過兩次並調離現職，２６９旅旅長楊方漢少將也記過兩次。
國防部表示，行政懲處中，陸軍司令李翔宙上將建議申誡部分，將呈總統核定。其中，５４２旅副旅長何江忠上校、人行科長何永欽上校、旅部連長徐信正少校、代理連士官督導長范佐憲上士各大過一次。２６９旅機二營禁閉室長蕭志明上士、副室長羅濟元中士與李念祖下士各大過一次。 洪仲丘的姊姊洪慈庸表示，現在的行政處分都只是表面，絕不接受國防部片面道歉，相關涉案人須接受法律制裁，希望國防部可以讓真相水落石出，目前沒計畫要提出多少賠償。
12人移送軍檢偵辦
據了解，這次李翔宙遭記申誡，是國軍因不當管教案第一次行政懲處上將，國軍之前上將遭行政懲處，是去年海軍發生的張鳳強演習違紀案，海軍司令董翔龍遭申誡一次。此外，六軍團指揮官被記過，也是相當嚴重的處分，５４２旅長沈威志少將已確定調陸軍司令部委員，除記過兩次還被移送軍法偵辦，軍旅生涯可能結束。此案共有十二人移送軍檢偵辦。
且即日起暫停士官兵禁閉悔過懲罰，目前執行禁閉中人員，由權責主官依《陸海空軍懲罰法》規定調整。
國防部表示，軍檢單位於七月四日獲報後，立即進行相驗及偵查，並查扣禁閉室錄影主機，會同家屬勘驗錄影帶，並偵訊相關人員，務期盡速還原事實真相。