台灣每年從紐西蘭進口的農業產品相當多，像是奇異果、蘋果、奶粉、牛肉以及羊肉等。若台紐簽訂經濟合作協議(ECA)，未來這些進口的相關食品價格可望下降，對消費者是利多；另一方面，卻可能對台灣的農民造成衝擊。
台大農經系主任徐世勳指出，以過去和農民座談的結論來看，ECA可能對鹿茸等特殊農業的影響較為明顯，但整體來說，應是利大於弊。徐世勳說：『(原音)像幾個特定的，像是鹿茸，養一些水鹿的產業，座談會時，他們認為會有一些影響；另外就是鮮奶也不會影響很大。我們那時候受影響的農家和酪農都有來開會，我感覺應該是利大於弊。』
中經院則評估，以降稅時程12年計算，ECA對台灣農產業產值影響將近新台幣30億。中經院WTO中心執行長李淳說：『(原音)我們農業部分會受到一些影響，以關稅來說，降稅時程是拉到12年，所以我們評估12年後，我們的農產業產值會受到一些影響，將近30億台幣。』
不過，中經院也強調，所謂產值減少30億的衝擊，是假設政府和農民沒有任何因應作為。李淳舉例，像之前台灣加入WTO時，研究單位也曾預估台灣農業產值將減少逾百億，但在農民轉型及政府相關配套措施下，十多年過去了，台灣農業產值反而創造了逾百億的成長。