台灣的水資源管理體系是支離破碎的！台灣河川的主管機關是經濟部水利署，業務包括水政、水利、灌溉、排水以及防洪等等；河川與其他水體的水質是否被污染則是由環保署負責；河川上游集水區的治理與森林保育屬於農委會林務局職權；涵養水源、淨化水質並能吸收與儲存洪水的內陸與沿海溼地，又是交由內政部營建署城鄉發展分署管理。
不管行政體系怎麼切割，水的物理特性就是由高處往低處流，降水落地之後，以分水嶺為界，將地理空間分割成不同的集水區與流域；分水嶺與流域是水在地表流動的自然疆界。
台灣雨量豐富，在極端氣候越來越顯著、搶奪水資源成為重要議題的21世紀，這原本是台灣的重要競爭優勢。雖然，台灣的河川多為長度短、陡度大，同時因冬、夏雨量分布不均，以至於豐水期與枯水期流量懸殊，但因為年總降雨量遠高於需求，只要在蓄水管理上，留住、涵養降下來的雨水，水資源的運用是可以充足供應民生與產業所需的。
近半個世紀，集水區山林的過度開發及水土保持的破壞，加上水體污染，使得台灣面對缺水困境。如何保護並供應乾淨、無污染的水資源絕對是未來的重要國家挑戰。水資源管理的核心精神必須回到水流的特性，流域內的水體、集水區與沿岸植群、及地下水之間，必非各自獨立，而是彼此相互關連，建構成錯縱複雜、環環相扣的河川生態系。因此，行政院組織改造將水、土、林等相關單位整合於環境資源部，就是要改變當前水資源管理單位多頭馬車的問題。
未來水資源管理應從流域的角度進行整體性思考，空間面向要從集水區、上游、中游、下游、到出海口來規劃，專業上則要整合水利、水質、水土、生態、國土規劃等領域，提出流域的水資源管理藍圖。但若依立法院審議中的環資部組織架構草案，水、土、林的整合若成為只將原有的單位搬動到環資部之下，無法改變過去各單位本位主義的問題。另外，立院目前黨團協商，有立委提出修正動議，主張未來農業部設仍林業司主管公私有林之林產利用、城鄉綠美化、樹木保護、及三大平地森林園區，並設林業試驗所負責林業之研究，其理由為「照顧林農」。若不能以「大破」精神貫徹原先流域管理整合的目標，在慣性、利益與地盤角逐中，組織改造很快地就會名存實亡。
畏於改變是人之常情。尤其是，組織改造牽涉到工作方式與指揮關係的改變，要是不能「大破」，本於零基組織的精神、將原有組織徹底打散，往往就會在人情包袱下因循故舊。這也就是為什麼大多數的組織改造，最後不僅舊的窠臼沒有消除，組織卻越改越肥！
（看守台灣協會會員）