農委會前家畜衛生試驗所長劉培柏指出，現任家衛所副研究員李敏旭、中興大學獸醫系的博士論文《台灣家禽流行性感冒病毒之特性與分子診斷》，其中一章以〈一九七二年至二○○五年台灣Ｈ６Ｎ１家禽流行性感冒病毒分離株之基因與病原性特徵〉為題，發現從一九九七年家禽場分離到的Ｈ６Ｎ１病毒株與香港、大陸不同，為台灣特有的本土株，若與其它疾病混合感染會造成相當損失。
來自雞隻病毒 可感染哺乳類
這份報告提到，在動物接種實驗中，某些直接採自雞隻上顎病毒株，可在小白鼠身上增殖，顯示這些病毒可跨物種造成哺乳動物感染。劉培柏表示，當時官方認為不會發生、未獲重視，不幸的是讓他說中了。
台大獸醫系名譽教授賴秀穗表示，在小白鼠身上增殖顯示Ｈ６Ｎ１已經變異可以感染哺乳類動物，政府應盡速做出每一年的基因序列比對，看它到底在哪一段出現變異。由於感染Ｈ６Ｎ１症狀輕微，絕對不可能只有一個人遭感染，基因經四十一年演變已是「Ｈ７Ｎ９的翻版」，政府必須盡速亡羊補牢，若擴大感染時才處理，恐將為時以晚。
避免擴大感染 學者促補破網
這篇論文的指導老師、前中興大學獸醫學院院長謝快樂說，此研究不能證明哺乳類會感染。當時口試委員、現任家衛所長蔡向榮則說，研究報告可做為參考，表示Ｈ６Ｎ１傳染人類風險較高，「就像上樓梯走一步或兩步，此研究證實Ｈ６Ｎ１多走了兩、三步，在未到達最後階段前，仍不足以證實會傳染給人。」
六月廿一日疾管局公布Ｈ６Ｎ１傳人事件以來，防檢局強調已到患者家周圍一公里內兩養禽場採樣，證實環境中並無Ｈ６Ｎ１存留，卻有別以往公布採樣時間，以「不記得」、「沒紀錄」為由，不願公布何時採樣。
防檢局談採樣 不願公布時間
《不能戳的祕密》導演李惠仁質疑，防檢局恐怕是採樣時間太晚，搞不好採樣與感染的雞隻根本不是同一批，「甚至根本沒去才不敢講。」
防檢局副局長趙磐華昨天說明，防檢局只是配合疾管局要求採樣周圍養禽場有沒有Ｈ６Ｎ１，他語氣激動地說，「我個人認為採樣只針對環境，哪一批雞不是重點」、「說有去就有去，時間點不重要！」