原先在淡水紅毛城園區入口處的七面國旗，最近搬新家到紅毛城主堡露台前飄揚，而且新增明鄭及清朝兩面國旗，變成了九面國旗，淡水古蹟博物館代理館長廖文卿表示，為了讓這九面國旗與紅毛城主堡相互呼應且更具故事性，特別將國旗從入口處移到紅毛城主堡露台前，極具獨特性的九面國旗象徵三百多年來先後管理或代管過紅毛城的國家，分別是西班牙、荷蘭、明鄭、清朝、英國、日本、澳大利亞、美國、中華民國，紅毛城的身世就是臺灣歷史的縮影，更見證了三百多年來臺灣多元的文化面貌。
17世紀初期西班牙從基隆進入臺灣，西元1629年來到滬尾（淡水），在淡水河口制高點上建築一座軍事堡壘「聖多明哥城」。西元1642年荷蘭趕走西班牙，於西元1644年建立今日的安東尼堡，因當時外國人髮色偏紅，所以當地人將城堡暱稱為紅毛城。
西元1661年鄭成功趕走荷蘭人，西元1683年明鄭為防清兵攻臺，命北路總督左武衛將軍何祐加強淡水防務，並修築紅毛城。西元1724第一任淡水廳捕盜同知王汧為北臺的防務整修紅毛城。英法聯軍之役後淡水開港，19世紀中葉英國向清廷租借紅毛城當作英國領事館，租期99年，紅毛城正式成為英國租借地，並於西元1891年在紅毛城東側加蓋領事住家，即英國領事官邸。日治時期，西元1941年12月太平洋戰爭爆發，英國暫時撤館，日本代為管理，二戰結束後，英國返回繼續開辦領事業務。
西元1972年英國撤館，交由澳大利亞代為管理。同年，澳大利亞與中華民國斷交，紅毛城輾轉委託美國代管。西元1979年中華民國與美國斷交，經政府多方努力，于西元1980年6月30日正式收歸中華民國所有，並列為國定古蹟，整修完工後，於西元1984年正式對外開放，從此，青天白日滿地紅的國旗，在砲臺埔的高崗上飄揚著。
淡水古蹟博物館代理館長廖文卿表示，紅毛城三百多年來佇立在淡水砲臺埔上，眺望著山腳下的人民，雖然時光不停地流轉，在歷經不同政權的轉換，但是紅毛城依然屹立不搖的在淡水高崗上迎接遊客的到來，這就是古蹟存在的價值。
目前淡水紅毛城及其週遭歷史建築群，為文化部選出國內世界遺產潛力點之一，自民國94年開館以來，累計參觀人數已突破六百萬人次，歡迎民眾到紅毛城欣賞這位來自三百多年前的老朋友。
紅毛城開放時間為週一至週五9:30-17:00；週六、週日 9:30-18:00，戶外庭園區延長開放至22:00。博物館免費參觀，詳情請電(02)26231001分機26或上淡水古蹟博物館網站http://www.tshs.ntpc.gov.tw查詢。