台灣歷年來日本腦炎之流行季節主要在5月至10月間，高峰期常發生在6到7月，日本腦炎潛伏期為5至15天，主要病媒蚊是三斑家蚊，感染後致死率可高達20%至30%，而存活的病患多數導致腦炎及嚴重之神經後遺症。豬是日本腦炎流行最重要的增幅動物，少部分則為禽鳥，日本腦炎病毒先在豬、禽鳥體內大量繁殖，病毒再經由三斑家蚊傳染給人類，三斑家蚊吸血高峰期為黃昏與黎明時分，呼籲民眾應注意做好防蚊措施，並請左營區及鼓山區醫療院所醫師提高警覺加強通報，疑似患者予以轉診區域級以上醫療院所加強照護。
疫苗接種是預防日本腦炎最有效的方法，台灣地區自民國57年起針對幼兒全面性施打日本腦炎疫苗，病例數逐年大幅下降。現行幼童日本腦炎疫苗接種時程為出生滿15個月接種第一劑，間隔2週接種第二劑，隔年接種第三劑，滿5歲至國小一年級入學前接種第四劑，請家長儘速帶幼童按時完成疫苗接種。本市如因工作或生活場所中有感染之虞（如禽畜養殖業者、農民或居家周邊鄰近水稻田者），且有意願接種疫苗的成人，可至小港醫院、市立聯合醫院及署立旗山醫院自費接種。
衛生局再度呼籲市民，除了預防接種之外，亦應養成良好的健康與衛生習慣，注意居家環境清潔，如處理積水、清除雜草，家中應裝設紗窗紗門。水稻田、田野溝渠、水潭等有水源之處所最易孳生傳播日本腦炎的三斑家蚊，盡量避免於病媒蚊活動的高峰期（黃昏及黎明時分）在豬舍、其他動物畜舍及前述地點附近活動，或應著長袖長褲、塗抹衛生署核可之防蚊藥劑避免蚊蟲叮咬，以降低感染風險。
成人日本腦炎疫苗接種須知
疫苗成分及效果：
日本腦炎疫苗是一種不活化的疫苗，由感染日本腦炎病毒的新生白鼠腦部組織的懸浮液所純化製成，接種效果達百分之八十五以上，所以接種疫苗是最有效的預防方法。
疫苗接種方式：
1).接種方式為：皮下注射於上臂外側（二歲以下幼兒，建議接種於大腿前外側）。
2).成人未曾接種者：建議施打3劑，接種第1劑後，隔2週接種第2劑，隔年接種第3劑。（第2、3劑至少間隔6個月）。
3)旅遊民眾:
a.皮下注射3劑，建議時程為0，7，30天各一劑。
b.若因出國時間之限制，另一縮短的建議接種時程為0，7，14天各接種一劑。
接種禁忌：
注射日本腦炎需先經醫師看診評估，若是孕婦、感冒發燒、曾對疫苗過敏或不良反應等下列情形者，則不適合接種。
先前接種本疫苗或對本疫苗任何成分曾發生嚴重過敏反應者。
發燒或正患有急性中重度疾病者，宜待病情穩定後再接種。
其他經醫師評估不適合接種者，不予接種。
副作用：
疫苗接種後少數可能發生局部紅腫、硬塊與疼痛等反應。偶有全身反應如發燒、頭痛及倦怠感，通常二至三天內會消失，發生嚴重的反應，約百萬分之一發生機率。
幼兒日本腦炎疫苗接種
請按時帶家中出生滿十五個月的幼兒接種第一劑疫苗，間隔二週再接種第二劑疫苗，隔年還需要再接種第三劑疫苗，滿5歲至國小一年級入學前接種第四劑。完整接種四劑日本腦炎疫苗後，面對日本腦炎病毒就多了一層保護力。